出入境货物实施“先报检，后报关”的通关模式。 凡法律、行政法规、规章或国际公约规定须经检验检疫机构检验检疫的出境货物，经检验检疫机构检验检疫合格的，签发“出境货物通关单”，作为海关核放货物的依据；经检验检疫不合格的，签发“出境货物不合格通知单”，不予放行；同时，根据对外贸易关系人的申请，经检验检疫合格的，可签发相应的检验检疫证书用于结算及进口国通关等。
凡法律、行政法规、规章或国际公约规定须经检验检疫机构检验检疫的入境货物，检验检疫机构接受报检后，先签发“入境货物通关单”（废旧物品及活动物除外），海关据以验放货物。然后，经检验检疫机构检验检疫合格的，签发“入境货物检验检疫证明”，不合格的对外签发检验检疫证书，供有关方面对外索赔。需异地实施检验检疫的，口岸检验检疫机构签发“入境货物通关单”（四联），通关后货主到到货地检验检疫机构办理报检手续，由到货地检验检疫机构施检。